Alkimia terikat oleh Hukum Setara Setara ini-sesuatu yang oleh saudara laki-laki Edward dan Alphonse Elric baru menyadari setelah mencoba transmutasi manusia: satu tindakan alkimia terlarang. Mereka membayar harga yang mengerikan untuk pelanggaran mereka-Edward kehilangan kaki kirinya, Alphonse fisik tubuhnya. Hanya dengan pengorbanan putus asa lengan kanan Edward sehingga ia bisa membubuhkan jiwa Alphonse dengan jas pelindung. Kehancuran dan kesepian, merupakan harapan bahwa mereka berdua akhirnya kembali ke tubuh asli mereka yang memberi Edward inspirasi untuk mendapatkan tungkai logam yang disebut “automail” dan menjadi alkemis negara, Fullmetal Alchemist.Tiga tahun kemudian, saudara-saudaranya mencari Batu Bertuah, sebuah peninggalan mitos yang memungkinkan ahli alkimia untuk mengatasi Hukum Setara Setara. Bahkan dengan sekutu militer, Kolonel Roy Mustang, Letnan Riza Hawkeye, dan Letnan Kolonel Maes Hughes di pihak mereka, saudara laki-laki menemukan diri mereka terjebak dalam persekongkolan nasional yang membawa mereka tidak hanya pada sifat sejati Batu Filsuf yang sulit dipahami, namun kerakusan negara mereka sejarah juga. Di antara menemukan pembunuh berantai dan berpacu melawan waktu, Edward dan Alphonse harus bertanya pada diri sendiri apakah tindakan mereka akan membuat mereka menjadi manusia lagi … atau menyingkirkan kemanusiaan mereka.