Penduduk planet Bumi yang tidak menaruh curiga akan melakukan bisnis mereka, menikmati hari yang cerah dan sangat indah, ketika seorang anak muda Jepang melihat benda berkilau jatuh dari langit … Apakah invasi alien akhirnya dimulai? Di tempat lain di Jepang, Keroro, sersan katak dan pemimpin Pelaut Taktis Khusus Angkatan Darat dari Invasi Khusus Planet ke-58 di Sistem Planetary Gamma, telah menemukan tempat persembunyian yang sempurna. Dia menginfiltrasi rumah keluarga Hinata dalam upaya untuk mendirikan sebuah markas yang dia dan tentaranya dapat gunakan untuk mempersiapkan dominasi dunia … tapi bumi Fuyuki dan Natsumi Hinata terlalu berat baginya untuk ditangani! Natsumi secara naluriah memanggil mereka untuk tidak bersembunyi, membiarkan sersan yang malang itu tidak punya pilihan kecuali mengungkapkan identitas rahasianya. Kedua saudara kandung itu segera menyambut sersan itu ke rumah mereka, semua berkat tipu muslihat Fuyuki-rasa ingin tahu. Sersan berhasil menyusup ke daerah sasaran pertamanya! Atau apakah dia? Bergabunglah dengan Keroro Gunsou dalam usahanya yang kejam untuk menguasai dunia!