Cerita berawal dengan pertarungan antara ZET dan ALPHAS. Jin Kanzaki, seorang pemuda dengan kemampuan untuk berubah menjadi manusia super yang dikenal sebagai ZET. Dan Kouga Amagi, seorang pemuda. dengan rasa keadilan yang kuat yang menggunakan teknologi untuk berperang sebagai ALPHAS. Nasib kedua orang ini dan orang-orang di sekitar mereka saling terkait saat mereka berjuang untuk melindungi umat manusia dan menghancurkan kekejian mengerikan yang dikenal sebagai Players.